ゲノム・遺伝子・タンパク質等の生物系ビッグデータ解析に必要なバイオインフォマティクスの基礎知識
~生命情報データの取得方法、核酸・アミノ酸配列解析、タンパク質立体構造情報解析、機械学習/深層学習の使用例等~
☆「そもそもバイオインフォマティクスって何?」という方から、「得られたデータをどうやって使うの?」というご担当者様に至るまで。
☆入門講座として、基礎から実務につなげるための要所を解説致します。
セミナー趣旨
近年、ゲノム、遺伝子、タンパク質など生命情報のビッグデータが急速に蓄積され、それらを自在に“料理”する 計算分野(バイオインフォマティクス)が不可欠になっています。本講義では入門編として、バイオインフォマティクスで扱う基礎的手法を紹介し、それらを実際にコンピュータに向かって習得することを目指します。
具体的には、生命情報データの取得法や、ゲノム等のDNA配列や、タンパク質のアミノ酸配列の計算解析法、アミノ酸配列情報からのタンパク質の構造・機能予測などを学びます。また応用編として機械学習や深層学習などについても触れます。
「そもそもバイオインフォマティクスって何?」、「バイオビッグデータは、どうやったら使える?」と思われるお客様にもできる限り分かりやすいように、じっくりと進めて行こうと思います。
■講演中のキーワード
・生命情報データベース
・DNA、アミノ酸配列解析
・タンパク質機能・構造予測
・機械学習、深層学習
習得できる知識
・生命情報データベースからの必要な情報の取得法
・DNA配列、アミノ酸配列を使った計算解析手法
・タンパク質のアミノ酸配列から、その構造・機能情報の予測法
・タンパク質の立体データの解析方法、可視化方法
・機械学習、深層学習の原理、使用例など
セミナープログラム
1. バイオインフォマティクス概論
2. 核酸配列/アミノ酸配列解析
2-1 概論
2-2 核酸配列/アミノ酸配データベース
2-3 相同性検索
2-4 系統樹作製、機能アノテーション等
2-5 計算機実習
3. タンパク質立体構造情報解析
3-1 概論
3-2 タンパク質立体構造データベース
3-3 立体構造の可視化解析
3-4 アミノ酸配列からの立体構造予測
3-5 計算機実習
4. 機械学習入門
4-1 概論
4-2 サポートベクターマシン
4-3 ニューラルネット
4-4 深層学習原理
4-5 応用例紹介
5. Q&A
セミナー講師
青山学院大学
理工学部 化学・生命科学科 理工学研究科 生命科学コース 教授
博士(理学)
諏訪牧子 先生
■経歴
1989年~1995年 東京農工大学 工学部 教務職員
1996年~ 東京農工大学 工学部 助手
1997年~ (株)ヘリックス研究所 主任研究員
2000年~ 電子技術総合研究所 知能情報科学部 主任研究官
2001年~ 独立行政法人産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター・ゲノム情報科学チーム 研究チーム長
2003年~ 独立行政法人産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 副研究センター長
2007年~ 独立行政法人産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 主幹研究員
2012年~現在 青山学院大学 理工学部教授
大学院 理工学研究科教授
■専門および得意な分野・研究
・バイオインフォマティクス
・ゲノム情報学
・生物物理学
■本テーマ関連学協会での活動
・日本バイオインフォマティクス学会
・日本生物物理学会
セミナー受講料
【オンラインセミナー(見逃し視聴なし)】1名41,800円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円
【オンラインセミナー(見逃し視聴あり)】1名47,300円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき36,300円
*学校法人割引;学生、教員のご参加は受講料50%割引。
受講について
※本講座は、お手許のPCやタブレット等で受講できるオンラインセミナーです。
配布資料・講師への質問等について
- 配布資料はPDF等のデータで送付予定です。受取方法はメールでご案内致します。
(開催1週前~前日までには送付致します)。
※準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
(土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。) - 当日、可能な範囲で質疑応答も対応致します。
(全ての質問にお答えできない可能性もございますので、予めご容赦ください。) - 本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、
無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売等を禁止致します。
下記ご確認の上、お申込み下さい
- PCもしくはタブレット・スマートフォンとネットワーク環境をご準備下さい。
- ご受講にあたり、環境の確認をお願いしております(20Mbbs以上の回線をご用意下さい)。
各ご利用ツール別の動作確認の上、お申し込み下さい。 - 開催が近くなりましたら、当日の流れ及び視聴用のURL等をメールにてご連絡致します。
Zoomを使用したオンラインセミナーとなります
- ご受講にあたり、環境の確認をお願いしております。
お手数ですが下記公式サイトからZoomが問題なく使えるかどうか、ご確認下さい。
→ 確認はこちら
※Skype/Teams/LINEなど別のミーティングアプリが起動していると、Zoomでカメラ・マイクが使えない事があります。お手数ですがこれらのツールはいったん閉じてお試し下さい。 - Zoomアプリのインストール、Zoomへのサインアップをせずブラウザからの参加も可能です。
※一部のブラウザは音声(音声参加ができない)が聞こえない場合があります。
必ずテストサイトからチェック下さい。
対応ブラウザーについて(公式) ;
「コンピューターのオーディオに参加」に対応してないものは音声が聞こえません。
申込み時に(見逃し視聴有り)を選択された方は、見逃し視聴が可能です
- 開催5営業日以内に録画動画の配信を行います(一部、編集加工します)。
- 視聴可能期間は配信開始から1週間です。
セミナーを復習したい方、当日の受講が難しい方、期間内であれば動画を何度も視聴できます。
尚、閲覧用のURLはメールにてご連絡致します。
※万一、見逃し視聴の提供ができなくなった場合、
(見逃し視聴有り)の方の受講料は(見逃し視聴無し)の受講料に準じますので、ご了承下さい。
→こちらから問題なく視聴できるかご確認下さい(テスト視聴動画へ)パスワード「123456」