マイクロバイオーム解析入門～マイクロバイオームの基礎、解析手法、得られたデータの考え方、解析に必要な統計手法など～

セミナー趣旨

  腸内細菌をはじめとするヒト常在の微生物叢(マイクロバイオーム)はヒトの健康に大きく影響することが近年明らかになった。本講座では、まずNGSを用いた16SrRNA解析の具体的なデータ処理を紹介する。得られたデータに対するデータマイニングツールやよく用いられる統計手法なども共有し、メタゲノム解析実践のための実践的な疑問に答えていく。また、進化を続けるシークエンサーを用いた最先端のメタゲノム解析手法についても実例を用いて紹介する。

受講対象・レベル

・16S解析に挑戦してみたいが、データ処理の具体的な部分がわからない方
・16S解析に挑戦してみたが、データの解釈がわからなかった方
・メタゲノム解析の全容を知りたい方

習得できる知識

・NGSを用いた16SrRNA解析で得られる結果/データの見方と実際のデータ処理
・NGSを用いたメタゲノム解析で用いられる統計手法(データ処理、データマイニング等含む)
・最新のメタゲノム研究

セミナープログラム

1．ヒトマイクロバイオーム
　1-1.ヒトマイクロバイオームとは
　1-2.ヒトとマイクロバイオームの共進化
　1-3.ヒトとマイクロバイオームの相互作用
2．マイクロバイオームの解析手法
　2-1.マイクロバイオーム研究の流れ
　2-2.Unseen majority
　2-3.解析手法の選択
3．アンプリコン解析
　3-1.アンプリコン解析とは
　3-2.16SrRNA遺伝子解析
　3-3.データマイニングの流れ
　3-4.データ解釈
4．ショートリードメタゲノム解析
　4-1.メタゲノム解析とは
　4-2.データマイニングの流れ
　4-3.データ解釈
5．最新のメタゲノム研究
　5-1.細菌の増殖率推定
　5-2.メタゲノムから作る疑似ゲノム
　5-3.ロングリード解析
　5-4.ウイルス・真菌・寄生虫
　5-5.腸内での微生物進化
6．まとめ
＜終了後、質疑応答＞

■講演中のキーワード
・マイクロバイオーム
・腸内細菌
・16SrRNA解析
・メタゲノム
・シークエンサー

セミナー講師

 コーネル大学 the Department of Biomedical Engineering, Research Associate 博士(医科学)    高安 伶奈 氏

■ご経歴
2012年東京大学理学部卒業。2014年、2017年に東京大学大学院・新領域創成科学研究科にて修士号、博士号を取得。
同年4月より、理化学研究所にて特別研究員着任。
2018年より東京大学医学系研究科にて助教着任。2023年4月より現職に至る。
■ご専門および得意な分野・ご研究
微生物生態学

セミナー受講料

【オンラインセミナー（見逃し視聴なし）】：1名45,100円(税込（消費税10％）、資料付)
＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき34,100円

【オンラインセミナー（見逃し視聴あり）】：1名50,600円(税込（消費税10％）、資料付)
＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき39,600円

＊学校法人割引；学生、教員のご参加は受講料50％割引。

受講について

• 配布資料はPDF等のデータで送付予定です。受取方法はメールでご案内致します。
  （開催1週前～前日までには送付致します）
  ※準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
  （土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。）
• 受講にあたってこちらをご確認の上、お申し込みください。
• Zoomを使用したオンラインセミナーです
  →環境の確認についてこちらからご確認ください
• 申込み時に（見逃し視聴有り）を選択された方は、見逃し視聴が可能です
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