データ駆動型がんバイオマーカー探索のポイント

セミナー趣旨

　ゲノム医療（genomic medicine）や精密医療（precision medicine）の進歩に伴い、バイオマーカーの役割は疾患判別から薬剤有効性を判断するコンパニオン診断まで広がり、新たな指標の開発が求められています。これに応えるため、ゲノムワイドな公開オミックスデータを活用した新しい探索手法の研究が進展しており、遺伝子発現量の疑似相関の分離など、より精密な解析も可能になってきました。
　本セミナーでは、バイオマーカー探索に取り組む方を対象に、オミックスデータを活用した実践的な解析手法、数理的手法の生物学的な解釈方法、および研究動向の把握を目標とします。基本的な統計学やプログラミングの知識を前提としますが、使用する手法の本質的な考え方については、具体例を通じて理解を深められるよう工夫を施しています。

習得できる知識

・複数のオミックスデータの統合的解析手法
・データ駆動型アプローチによるバイオマーカー探索法
・数理的手法（行列分解など）の生物学的解釈
・最新の研究動向と将来展望

セミナープログラム

１．はじめに
　1-1. 自己紹介
　1-2. セミナーの概要と目的

２．バイオマーカーの基礎知識
　2-1. バイオマーカーとは？
　2-2. バイオマーカーの種類 (診断、予測、安全性など)
　2-3. 測定対象と技術

３．がんバイオマーカー探索の最近動向
　3-1. オミックス時代のバイオマーカー
　3-2. 有効な情報・データの種類
　　3-2-1. 遺伝子発現データ
　　3-2-2. miRNAデータ
　　3-2-3. ゲノム配列変異情報
　　3-2-4. ゲノムメチル化情報
　　3-2-5. 薬剤応答とパスウエイ

４．研究事例
　4-1. 癌細胞と正常細胞との混合度を推定するがんバイオマーカー探索
　4-2. 行列・テンソル分解を用いた多軸のバイオマーカー探索

５．今後の課題と展望

６．質疑応答

キーワード：
バイオマーカー,バイオマーカ探索,オミックスデータ,遺伝子発現データ,WEB,セミナー

セミナー講師

富士通　富士通研究所　プリンシパル・リサーチャー　博士（生命科学） 村上 勝彦 氏

《専門》
ゲノム情報科学　バイオインフォマティクス　機械学習　人工知能

東京大学大学院新領域創成科学研究科　博士（生命科学）。
理化学研究所、産業技術総合研究所、東京大学医科学研究所等で長年にわたりヒトゲノム配列解析、遺伝子データベース開発(H-InvDB)、データマイニングなどに従事。2015年から教育分野へのICT活用も手掛ける。2018年より富士通研究所　人工知能研究所でAI（深層学習、自然言語処理）のゲノム医療への応用に携わる。

共著に「“医薬品・医療機器・再生医療”開発におけるオープンイノベーションの取り組み　事例集」(2018),「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」(2019)など。
受賞：2015年日本バイオインフォマティクス学会ポスター賞、2020年日本メディカルAI学会奨励賞、等。

《活動等》
2019年 - 現在 International Congress on Advanced Applied Informatics (IIAI-AAI), プログラム委員

セミナー受講料

49,500円（税込、資料付）
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　 2名同時申込の場合計49,500円（2人目無料：1名あたり24,750円）で受講できます。
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　  今回の受講料から会員価格を適用いたします。）
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