トランスクリプトーム解析の基本から応用まで ～トランスクリプトームでできること、基本的な考え方、より高度な解析へ～

セミナー趣旨

  遺伝子の発現を網羅的に計測するトランスクリプトーム解析は強力な研究手段となっています。そのスコープは基礎から応用、がんの診断のような医療にまで及びます。遺伝子の発現には計測誤差があることや、たんぱく質等の様々なレイヤーを経て生命現象に発露することから、その解析のためには確率・統計の基礎が求められます。より高度な生命現象を理解しようとすれば、より高度な統計モデルを使うことになります。本講座では、トランスクリプトーム解析の基本事項や、実際の解析に使えるサンプルコードや情報源を丁寧に紹介します。加えて、より高度な解析の入り口や、最近の研究事例を紹介します。

受講対象・レベル

・バイオインフォマティクス・トランスクリプトーム解析の初学者の方
・統計解析の考え方がいまいち掴めない方
・トランスクリプトーム解析の応用事例を知りたい方（発現量予測・ネットワーク解析）

習得できる知識

・トランスクリプトーム解析でできること、強み・弱み（向き・不向き）
・バイオインフォマティクス・トランスクリプトーム解析における統計解析の基本
・サンプルコードや解析に役立つ情報源
・トランスクリプトーム解析の研究事例（応用可能性）

セミナープログラム

１．トランスクリプトーム解析でできること
　1-1. ゲノムからポストゲノムへ
　1-2. セントラルドグマ―他のオミックス解析との関係性（補完関係）
　1-3. トランスクリプトーム解析が用いられる場面①（基礎研究、応用研究）
　1-4. トランスクリプトーム解析が用いられる場面②（医療）
２．トランスクリプトーム解析の事前知識
　2-1. データ取得方法の歴史（EST、SAGE等）
　2-2. トランスクリプトームデータを取得する実験手法①（マイクロアレイ）
　2-3. トランスクリプトームデータを取得する実験手法②（DNA chip）
　2-4. トランスクリプトームデータを取得する実験手法③（RNA-Seq）
　2-5. 計測データからの遺伝子発現量の推計
３．トランスクリプトーム解析基本編（原因遺伝子の同定）
　3-1. トランスクリプトーム解析の基本的な指針・流れ
　3-2. トランスクリプトーム解析のために求められる確率・統計
　3-3. データを比較するための準備（正規化・標準化）
　3-4. 単純な比較・可視化
　3-5. 発現量に差のある遺伝子の同定
　3-6. 発現パターンの類型化（クラスタリング）
４．トランスクリプトーム解析応用編（遺伝子発現メカニズムの推定）
　4-1. 遺伝子制御関係を推定する各種手法
　4-2. 遺伝子制御関係の推定１（ベイジアンネットワーク）
　4-3. 遺伝子制御関係の推定２（構造方程式モデリング）
　4-4. 遺伝子制御関係の推定３（ブーリアンネットワーク）
　4-5. 遺伝子発現の推定（プロモーター配列からの推定）
５．最近の話題
　5-1. シングルセルトランスクリプトーム解析
　5-2. メタトランスクリプトーム解析
　5-3. 単一分子ロングリード配列決定
　5-4. 空間トランスクリプトーム解析
＜終了後、質疑応答＞

■講演中のキーワード
・RNA-Seq
・正規化・標準化
・比較解析
・時系列データ
・制御ネットワーク

＊希望者は講師との名刺交換が可能です

セミナー講師

 谷口 丈晃 先生   国立研究開発法人産業技術総合研究所 生命工学領域 生物プロセス研究部門 総括研究主幹　

■経歴
京都大学大学院理学研究科生物学科修士課程（1997～1999）
株式会社三菱総合研究所（1999～2022）
国立研究開発法人産業技術総合研究所（2022～）
■専門および得意な分野・研究
バイオインフォマティクス（トランスクリプトーム解析、ゲノム解析）、ゲノム医療

セミナー受講料

【オンラインセミナー（見逃し視聴なし）】：1名41,800円(税込（消費税10％）、資料付)
＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円

【オンラインセミナー（見逃し視聴あり）】：1名47,300円(税込（消費税10％）、資料付)
＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき36,300円

＊学校法人割引；学生、教員のご参加は受講料50％割引。

受講について

※本講座は、お手許のPCやタブレット等で受講できるオンラインセミナーです。

配布資料・講師への質問等について

• 配布資料はPDF等のデータで送付予定です。受取方法はメールでご案内致します。
  （開催1週前～前日までには送付致します）。
  ※準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
  （土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。）
• 当日、可能な範囲で質疑応答も対応致します。
  （全ての質問にお答えできない可能性もございますので、予めご容赦ください。）
• 本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、
  無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売等を禁止致します。

下記ご確認の上、お申込み下さい

• PCもしくはタブレット・スマートフォンとネットワーク環境をご準備下さい。
• ご受講にあたり、環境の確認をお願いしております（20Mbbs以上の回線をご用意下さい）。
  各ご利用ツール別の動作確認の上、お申し込み下さい。
• 開催が近くなりましたら、当日の流れ及び視聴用のURL等をメールにてご連絡致します。

Zoomを使用したオンラインセミナーとなります

• ご受講にあたり、環境の確認をお願いしております。
  お手数ですが下記公式サイトからZoomが問題なく使えるかどうか、ご確認下さい。
  → 確認はこちら
  ※Skype／Teams／LINEなど別のミーティングアプリが起動していると、Zoomでカメラ・マイクが使えない事があります。お手数ですがこれらのツールはいったん閉じてお試し下さい。
• Zoomアプリのインストール、Zoomへのサインアップをせずブラウザからの参加も可能です。
  ※一部のブラウザは音声（音声参加ができない）が聞こえない場合があります。
  　必ずテストサイトからチェック下さい。
  　対応ブラウザーについて(公式) ;
  　「コンピューターのオーディオに参加」に対応してないものは音声が聞こえません。

申込み時に（見逃し視聴有り）を選択された方は、見逃し視聴が可能です

• 開催5営業日以内に録画動画の配信を行います（一部、編集加工します）。
• 視聴可能期間は配信開始から1週間です。
  セミナーを復習したい方、当日の受講が難しい方、期間内であれば動画を何度も視聴できます。
  尚、閲覧用のURLはメールにてご連絡致します。
  ※万一、見逃し視聴の提供ができなくなった場合、
  （見逃し視聴有り）の方の受講料は（見逃し視聴無し）の受講料に準じますので、ご了承下さい。
  →こちらから問題なく視聴できるかご確認下さい（テスト視聴動画へ）パスワード「123456」